แนวทางใหม่ที่รวดเร็วและก็มีคุณภาพสำหรับการสร้างโปรไฟล์ของเซลล์เดี่ยว

หลายเซลล์ในร่างกายของพวกเราปฏิบัติงานในลักษณะปกปิดวิทยาศาสตร์ที่ยังไม่เข้าใจ ที่ยังไปสำหรับเซลล์ภูมิต้านทานที่มีความจำเป็นสำหรับเพื่อการคุ้มครองพวกเราจากโรครุนแรง

เพื่อจะเอาชนะอุปสรรคนี้นักวิจัยพากเพียรอย่างมากสำหรับเพื่อการหาวิธีใหม่ในการศึกษาผลงานข้างในของเซลล์แต่ละเซลล์

ความท้าทายเป็นไม่เพียง แต่จะแยกเซลล์ออกจากแบบอย่างเนื้อเยื่อนอกจากนี้เรายังจำเป็นที่จะต้องหาวิธีการตรวจสอบหลักการทำงานของเซลล์แต่ละเซลล์ด้วย” ดร. เคดาร์ท้องนาธานที่นาน้ำผู้ช่วยศาสตราจารย์และหัวหน้างานวิจัยภาควิชาชีวเคมีและชีววิทยาระดับโมเลกุลกล่าว มหาวิทยาลัยเซาเทิร์นเดนมาร์ก

ในการค้นคว้าใหม่นำโดย Kedar Nath Natarajan รวมทั้ง Xi Chen จากสถาบัน Wellcome Sanger Institute ทีมงานนักวิจัยได้ปรับปรุงวิธีการใหม่ในการทำเป็นชิ้นเล็กชิ้นเล็กภายในอวัยวะและก็เนื้อเยื่อของกล้องจุลทรรศน์

กรรมวิธีการใหม่ช่วยทำให้พวกเขาสามารถพินิจพิจารณาเซลล์ได้มากกว่า 3000 เซลล์จากม้ามซึ่งเป็นจุดที่มีฮอตปอสำหรับเซลล์ภูมิต้านทานทุกจำพวก เซลล์ที่ต่อสู้กับการรับเชื้อ แต่ยังมีผลให้ภูมิต้านทานในชีวิตประจำวันและการโต้ตอบ

กรรมวิธีใหม่ๆได้รับการพัฒนาอย่างต่อเนื่องเพื่อแสดงรายละเอียดของเซลล์โดดเดี่ยวภายในอวัยวะและก็เยื่อ หลักการคือการศึกษาแบบเบื้องต้นของสิ่งมีชีวิตเช่น DNA และก็แนวทางการบรรจุข้างในเซลล์เดียว บรรจุภัณฑ์นี้เรียกว่า chromatin รวมทั้งสัญญาณที่ยีนข้างในพิมพ์เขียวถูกเปิดรวมทั้งปิดเพราะฉะนั้นจึงใคร่ครวญว่าจะกลายเป็นเซลล์เม็ดเลือดเซลล์ผิวหนังเซลล์ภูมิคุ้มกันเซลล์มะเร็งหรือเซลล์ชนิดอื่น

แนวทางการใหม่ของพวกเราสำหรับการทำให้โครเมียมข้างในเซลล์เดียวมีทางเลือกที่มีประสิทธิภาพสามารถปรับขนาดได้และก็ถูกกว่าสำหรับวิธีการที่ล้ำยุคที่สุดซึ่งจึงควรมีองค์ประกอบเบื้องต้นที่แพงแพงเครื่องใช้ไม้สอยพิเศษแล้วก็วัสดุอุปกรณ์ต่างๆ” นายติดอยู่เดรนาธัตนานันกล่า

ร่วมกับผู้เขียน Xi Chen คนแรกจากสถาบัน Wellcome Sanger Institute เขาเป็นผู้นำในการพัฒนาวิธีการใหม่ๆและก็สร้างรายละเอียดเกี่ยวกับเซลล์ต่างๆตัวอย่างเช่นเซลล์ภูมิคุ้มกันเซลล์ต้นกำเนิดฯลฯผู้ร่วมศึกษาค้นคว้าจากสถาบัน Wellcome Sanger เป็นต้นว่า Ricardo J Miragaia และงานนี้ได้รับการปฏิบัติงานในห้องปฏิบัติการของผู้เขียน Sarah A Teichmann ที่เกี่ยวข้อง

ข้อคัดย่อของกระดาษให้คำอธิบายนี้:

การตรวจค้นลำดับเบสของ transposase-chromatography (ATAC-seq) ใช้กันอย่างแพร่หลายเพื่อเจาะจงขอบเขตของระเบียบข้อบังคับทั่วอีกทั้งจีโนม อย่างไรก็ตามการศึกษาจำนวนน้อยได้รับการทำงานในระดับเซลล์เดี่ยว(scATAC-seq) เนื่องจากความท้าทายทางเทคนิค ตรงนี้เราได้ปรับปรุงวิธีการ scATACseq ที่เรียบง่ายแล้วก็มีคุณภาพโดยใช้การรวมแท็ก Tn5 ที่มีการจัดเรียงsingle-nuclei พวกเราทำให้เห็นว่าขั้นตอนการของพวกเราสามารถปฏิบัติงานได้อย่างสบายในระบบต่างๆแล้วก็เซลล์ที่สดและรักษาได้จากเนื้อเยื่อหลัก โดยทำโปรไฟล์มากยิ่งกว่า 3,000 splenocytes พวกเราจะระบุประเภทของเซลล์ภูมิต้านทานที่ไม่เหมือนกันออกไปและก็แสดงขอบเขตการกำกับดูแลเฉพาะที่เกี่ยวเนื่องกับเซลล์และก็ปัจจัยการถอดรหัสที่เกี่ยวข้อง